| ID | 花名 | 科 | 属 |
| 1231 | ミズオトギリ | オトギリソウ | ミズオトギリ |
| 12 | ミズギク | キク | オグルマ |
| 241 | ミズタマソウ | アカバナ | ミズタマソウ |
| 433 | ミズチドリ | ラン | ツレサギソウ |
| 445 | ミズトンボ | ラン | ミズトンボ |
| 524 | ミズバショウ | サトイモ | ミズバショウ |
| 420 | ミズヒキ | タデ | タデ |
| 565 | ミスミソウ | キンポウゲ | スハマソウ |
| 140 | ミソガワソウ | シソ | イヌハッカ |
| 417 | ミゾソバ | タデ | イヌタデ |
| 244 | ミソハギ | ミソハギ | ミソハギ |
| 178 | ミツガシワ | リンドウ | ミツガシワ |
| 385 | ミツバオウレン | キンポウゲ | オウレン |
| 1087 | ミツバコンロンソウ | アブラナ | タネツケバナ |
| 827 | ミツバツチグリ | バラ | キジムシロ |
| 1218 | ミツバツツジ | ツツジ | ツツジ |
| 805 | ミツマタ | ジンチョウゲ | ミツマタ |
| 1333 | ミドリハコベ | ナデシコ | ハコベ |
| 527 | ミネウスユキソウ | キク | ウスユキソウ |
| 1375 | ミネカエデ | カエデ | カエデ |
| 212 | ミネズオウ | ツツジ | ミネズオウ |
| 522 | ミミガタテンナンショウ | サトイモ | テンナンショウ |
| 61 | ミヤコアザミ | キク | トウヒレン |
| 292 | ミヤコグサ | マメ | ミヤコグサ |
| 537 | ミヤマアカバナ | アカバナ | アカバナ |
| 20 | ミヤマアキノキリンソウ | キク | アキノキリンソウ |
| 183 | ミヤマアケボノソウ | リンドウ | ミヤマアケボノソウ |
| 23 | ミヤマアズマギク | キク | シオン |
| 701 | ミヤマイワニガナ | キク | ニガナ |
| 534 | ミヤマウイキョウ | セリ | シラネニンジン |
| 6 | ミヤマウスユキソウ | キク | ウスユキソウ |
| 1367 | ミヤマウツボグサ | シソ | ウツボグサ |
| 508 | ミヤマエンレイソウ | ユリ | エンレイソウ |
| 376 | ミヤマオダマキ | キンポウゲ | オダマキ |
| 528 | ミヤマオトコヨモギ | キク | ヨモギ |
| 269 | ミヤマカタバミ | カタバミ | カタバミ |
| 1386 | ミヤマガマズミ | スイカズラ | ガマズミ |
| 702 | ミヤマカラマツ | キンポウゲ | カラマツソウ |
| 335 | ミヤマキケマン | ケシ | キケマン |
| 703 | ミヤマキスミレ | スミレ | スミレ |
| 299 | ミヤマキンバイ | バラ | キジムシロ |
| 365 | ミヤマキンポウゲ | キンポウゲ | キンポウゲ |
| 110 | ミヤマクワガタ | ゴマノハグサ | クワガタソウ |
| 65 | ミヤマコウゾリナ | キク | ミヤマコウゾリナ |
| 532 | ミヤマコゴメグサ | ゴマノハグサ | コゴメグサ |
| 122 | ミヤマシオガマ | ゴマノハグサ | シオガマギク |
| 1050 | ミヤマシキミ | ミカン | ミヤマシキミ |
| 705 | ミヤマシシウド | セリ | シシウド |
| 706 | ミヤマシャジン | キキョウ | ツリガネニンジン |
| 253 | ミヤマスミレ | スミレ | スミレ |
| 707 | ミヤマセンキュウ | セリ | ミヤマセンキュウ |
| 234 | ミヤマゼンコ | セリ | エゾノシシウド |
| 303 | ミヤマダイコンソウ | バラ | ミヤマダイコンソウ |
| 603 | ミヤマダイモンジソウ | ユキノシタ | ユキノシタ |
| 330 |
ミヤマタネツケバナ | アブラナ | タネツケバナ |
| 66 | ミヤマタンポポ | キク | タンポポ |
| 708 | ミヤマツボスミレ | スミレ | スミレ |
| 536 | ミヤマトウキ | セリ | シシウド |
| 611 | ミヤマトリカブト | キンポウゲ | トリカブト |
| 1157 | ミヤマナミキ | シソ | タツナミソウ |
| 710 | ミヤマバイケイソウ | ユリ | シュロソウ |
| 1320 | ミヤマハコベ | ナデシコ | ハコベ |
| 543 | ミヤマハタザオ | アブラナ | ハタザオ |
| 170 | ミヤマハナシノブ | ハナシノブ | ハナシノブ |
| 352 | ミヤマハンショウヅル | キンポウゲ | センニンソウ |
| 612 | ミヤマハンノキ | カバノキ | ハンノキ |
| 593 | ミヤマホツツジ | ツツジ | ミヤマホツツジ |
| 712 | ミヤマママコナ | ゴマノハグサ | ママコナ |
| 325 | ミヤママンネングサ | ベンケイソウ | キリンソウ |
| 545 | ミヤマミミナグサ | ナデシコ | ミミナグサ |
| 166 | ミヤマムラサキ | ムラサキ | ミヤマムラサキ |
| 1056 | ミヤマモジズリ | ラン | テガタチドリ |
| 606 | ミヤマヤナギ | ヤナギ | ヤナギ |
| 1184 | ミヤマヤブタバコ | キク | ガンクビソウ |
| 1358 | ミヤマヤマブキショウマ | バラ | ヤマブキショウマ |
| 802 | ミヤマヨメナ | キク | ミヤマヨメナ |
| 191 | ミヤマリンドウ | リンドウ | リンドウ |
| 1301 | ミョウガ | ショウガ | ショウガ |